On distingue sur le territoire national plusieurs zones végétales, qui se raccrochent à quelques grands domaines africains : domaine oriental avec les formations végétales du Burundi central. Domaine de l’Imbo et de la plaine de la Rusizi et du Bugesera au nord- est : domaine dit zambézien correspondant au pourtour sud et est du Burundi, notamment le Buragane, le Kumoso et le Buyogoma plus marginalement, où se trouvent des savanes et des forêts claires de type miombo (dites tropophiles) : enfin, le domaine afro montagnard sur la crête Congo- Nil, avec la fameuse forêt primaire de la Kibira, une forêt ombrophile où s’épanouissent diverses espèces animales et végétales exceptionnelles, dont un certain nombre sont endémiques au Burundi. Quelques influences guinéo- Congolaises se retrouvent également le long du Tanganyika, marquées par exemple par la réserve forestière périguinéenne de kigwena. Dans tous ces écosystèmes poussent de grands et beaux arbres avec fleurs ou non.